Laboratorium kimia MA Nurul Islam memliki luas bangunan 12 x 10 meter dan terletak di sebelah selatan sekolah. Laboratorium kimia memiliki bangunan yang cukup luas sehingga memiliki kapasitas yang memadai sekitar 40 siswa. Alat dan bahan yang disediakan di Laboratorium MA Nurul Islam ini cukup banyak dan terbilang lengkap untuk memenuhi proses pembelajaran yang akan dilaksanakan yaitu kebutuhan praktikum di jenjang sekolah menengah atas. Selain itu Laboratorium kimia di MA Nurul Islam ini diampu oleh guru kimia yaitu, Devi Septiani, S.Pd..
Laboratorium kimia merupakan sarana penting untuk menunjang pelaksanaan pembelajaran di MA Nurul Islam. Selain untuk praktikum pada saat proses pembelajaran, laboratorium kimia sangat dimanfaatkan para siswa untuk melakukan penelitian. Siswa dapat memanfaatkan ketersediaan alat-alat dan bahan yang ada di laboratorium kimia ini untuk melakukan penelitian. Selain itu laboratorium kimia juga memiliki fasilitas yang lengkap dan memenuhi standar, antara lain terdapat :
Selain untuk praktikum laboratorium kimia di MA Nurul Islam ini sering digunakan untuk proses pembelajaran biasa karena fasilitas yang disediakan sangat memadai dan memberikan kenyamanan kepada siswa.